Nat Biotechnol:研究不能段落?可能是HeLa细胞系“变”了

2021-12-13 03:02:16 来源:
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HeLa细胞膜已经在多国的许多麻省理工学院培训了据统计70年,并且长期以来被忽视是无限供应的不反为的并不相同细胞膜。然而,2月18日发表在《Nature Biotechnology》周报上的一项新数据分析表明,细胞膜在并不并不相同麻省理工学院间存在很大相异,这引发了对细胞膜则有数据分析经常持续性的回应。“我很高兴看到这项数据分析,但在某种意义上我并不倍感惊讶,”斯隆马修琳癌症中所心的昆虫学家Prasad Jallepalli却说,他无法加入这项数据分析。这并不是HeLa细胞膜则有自诞生以来第一次注意到多样化的报道:长期以来,其他数据分析一个小组也证明HeLa细胞膜个微相异微间在遗传序列和RNA表达出来的除此以外相异。这项最新数据分析首次全面分析了各种HeLa个微相异微的遗传个微相异(并不并不相同批次的HeLa细胞膜则有生活在多国的各个麻省理工学院),并且首次证明遗传异质持续性导致了蛋白质表达出来和表型的反为化。HeLa细胞膜“反为了”?在这项数据分析中所,数据分析工作人员从6个国内的13个麻省理工学院收集了14份HeLa样本,并在并不相同的麻省理工学院状况下进行培训。他们首先举例来却说了遗传拷贝数个微相异,揭示了它们遗传组间的除此以外相异。结果发现,HeLa个微相异微间,特别是CCL2和Kyoto个微相异微间存在着巨大的异质持续性。进一步的分析表明,许多这些遗传相异转化为mRNA产生的反为化,并且在较大程度上转化为蛋白质核素的反为化。数据分析工作人员分析报告却说,HeLa CCL2和Kyoto细胞膜则有的转录组和蛋白质组谱彼此间的相异,就像来自两种并不并不相同种类组织的肿瘤细胞膜则有间的相异一样。HeLa个微相异微在培训操作过程中所生长加速也并不并不相同,一些细胞膜;也需要17.5每隔才能翻倍,而另一些细胞膜在并不相同的培训状况下需要话费超过32每隔。它们对沙门氏菌感染的反应也有所并不并不相同:与其他两种反为微相比,一种反为微对感染的敏感持续性高,数据分析工作人员将其值得注意低水平的蛋白质复合物,这种蛋白质复合物在大肠杆菌进入寄主细胞膜中所起作用。在一项之外的试验中中所,数据分析一个小组通过培训细胞膜则有三个月,来通过观察HeLa个微相异微的表观出来是否会随着时长发生反为化。数据分析工作人员历史纪录了早期细胞膜和晚期细胞膜间表观出来相异大约6%。斯图加特州政府理工学院分子则有统生物学数据分析所的Ruedi Aebersell教授是该数据分析的合着者,他却说,“即使在同一个麻省理工学院里,这些细胞膜的相异和反为化加速也是极为惊人的。”他估计,如果一个名教授在项目开始时用HeLa细胞膜则有想到了一个试验中,并在六个月后被决定重复这个试验中,他们可能会得到并不并不相同的结果。关于数据分析中所的“可复制持续性灾难”的讨论大多数密集所在试验中设计、数据分析方面的缺陷,以及作为主要驱动因素的不受污染或贴错标签的细胞膜则有。但是Aebersell忽视,HeLa细胞膜则有和肿瘤细胞膜则有的生物学相异可能是关键。为什么会“反为”?哥伦比亚大学的细胞膜遗传学家Tim Stearns忽视有几个可能的可能可以解释为什么细胞膜则有在长时长培训除此以外发生反为化。首先,HeLa细胞膜是推断遗传组不稳定的肿瘤细胞膜,因此很可能随时长随机遗传突反为。此外,它们还会在麻省理工学院中所不受到各种生长状况的不受到影响,这可能会更进一步细胞膜变异出独特的特征。例如,他却说,哺乳动物细胞膜的培训以外将其培训到充满一个培训皿为止,从培训皿中所抽取一部分细胞膜,然后将它们放在另一个培训皿中所生长,这一操作过程特指分裂。“每个人想到这件事的方式将都看上去并不并不相同,”他却说道。最新这些发现,对于人类培训细胞膜的数据分析结果的解释和展现持续性有一定的意义。Aebersell和他的上司在论文中所提出异议了几个具微的提高效率。首先,数据分析工作人员应该用于肿瘤细胞膜则有的早期传代,并确保在同一细胞膜则有的并不并不相同样本中所重复同一细胞膜则有的试验中。更重要的是,遗传学家应该吻合地分析报告他们在给定的数据分析中所用于的细胞膜则有个微相异微。
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