Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 转变成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和单链 DNA 组成的特殊核糖构件，在原核和真核生物的DNA之前产自尤其且比如说。R-loop 在很多关键的生物化学过程之前充分发挥重要功能性，包括线粒体构件上、RNA调节、DNA 损伤修复以及DNA比较稳定性等，但其如何被精确调节的必要尚能不正确。m6A 构件上作为几天后 RNA 上稀土元素最高的构件上类型，尤其参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞核新增、脂肪组织分化、以及生成和转回等心灵过程。然而，目前为止尚能不正确 m6A 是否能作为 R -loop 之前 RNA 溶剂的奥秘相似性来调节 R -loop 水平，进而充分发挥各种生物化学功能性。之前科院北京DNA研究工作所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前题名一个团队共同研究工作，挖掘出 m6A 能比较稳定 R-loop 的成型，进而调节基因序列RNA的有效终止。这一重大突破以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日该网站发表于《细胞核研究工作》（Cell Research）杂志。研究工作一个团队首先通过斑点分子杂交和免疫荧光关键技术，挖掘出敲低 m6A 及第基转回酶 METTL3 显着降低 R -loop 水平，且该调节主导作用依赖于 METTL3 及第基转回酶活性。随后，一个团队新成员并用高效液相气相联合质谱关键技术，挖掘出比起于基因序列结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 溶剂有更加富集的 m6A 构件上。再进一步并用基于单链 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链免疫共沉淀高通量测序关键技术（ssDRIP-seq），挖掘出下调的 R -loop 主要富集在RNA终止区域，R-loop 巨大变化程度与 m6A 的距离和构件上水平关的。为了探索 m6A 对 R -loop 调节的生物化学功能性，研究工作一个团队绘制了 RNA 聚合酶RNA核糖体的高分辨率图谱，并在 MYC、ACTIN 基因序列上顺利完成多种RNA活性样品，挖掘出 m6A 促进 R -loop 成型是RNA终止前期的关键性，可以防止 RNA 聚合酶的RNA通读。最后，一个团队新成员构建了针对RNA通读的报告基因序列该系统，通过 m6A 构件上核糖体的突变再进一步证实 m6A 对于 R -loop 成型及RNA终止的关键主导作用。该研究工作挖掘出了 m6A 及第基化构件上的共RNA调节功能性，阐述了 RNA 及第基化构件上对线粒体构件的影响，以及 R-loop 构件之前的 RNA 溶剂被构件上后对其自身稳态的调节必要，探究了 m6A 通过比较稳定 R-loop 而促进RNA正常终止的现象，为再进一步研究工作 m6A 与 R-loop 的调节必要和相应生物化学功能性提供了基本的关键技术和理论支架。该研究工作得到了之前国科学院国防工业先导信息技术专项、国家自然科学以及国家综合研发计划等基金资助。完整说是：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).