Sci Rep:5-miRNA标签不同之处可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2022-02-14 12:56:17 来源:
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这项研究力图考虑到一种可以预期食管鳞状细胞癌(ESCC)病变基本上增重(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC病变的miRNA解读谱及其相应的临床的资讯,并将其作为培训集。在以前和晚期比对间比对差异连续性解读的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox紧接著分析方法、运算符相似连续性抑止(RFE)-支持者乘积机(SVM)算法和LASSO Cox紧接著三维来识别系统病症连续性miRNAs,从而创建病症满分三维。此外,预期了这些病症连续性miRNAs的有前途靶等位基因,然后构建了miRNA靶等位基因网络。通过机制富集分析方法,分析方法了ESCC中这些病症连续性miRNAs预期靶等位基因的机制不考虑到连续性。

在培训集中于,以前与晚期比对有46个DEmiRNAs。创建了基于5个miRNAs的几率满分三维。该5-miRNA几率满分可以将培训集分为OS一段时间引人注意不同的高危组和低危组。在一个来自肺癌等位基因序列图谱(TCGA)的独立数据库集中于,取得成功测试了5-miRNA几率满分的几率分层能力。已考虑到了与这些miRNAs无关的各种生物学过程和通路,例如Wnt瞬时通路、TRP通道的坏死颗粒适度通路和雌二醇瞬时通路。

这项研究提示,与病理分期无关的5-miRNA标签对预期ESCC病变的病症具有临床意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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